MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 72091

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010658	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731657
2	NC_010658	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731657
3	NC_010658	CGG	2	6	353	358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733611
4	NC_010658	CAGG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	187733611
5	NC_010658	CT	3	6	444	449	0 %	50 %	0 %	50 %	187733611
6	NC_010658	ACCA	2	8	465	472	50 %	0 %	0 %	50 %	187733611
7	NC_010658	TGG	2	6	475	480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733611
8	NC_010658	GAT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733611
9	NC_010658	A	6	6	490	495	100 %	0 %	0 %	0 %	187733611
10	NC_010658	CGC	3	9	569	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733611
11	NC_010658	TCG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733611
12	NC_010658	TTG	2	6	663	668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733611
13	NC_010658	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	187733611
14	NC_010658	CTG	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733611
15	NC_010658	CCG	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733611
16	NC_010658	TGG	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733611
17	NC_010658	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733611
18	NC_010658	CGG	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733611
19	NC_010658	GCTG	2	8	974	981	0 %	25 %	50 %	25 %	187733611
20	NC_010658	TTG	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733611
21	NC_010658	GGAC	2	8	1012	1019	25 %	0 %	50 %	25 %	187733611
22	NC_010658	GTT	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733611
23	NC_010658	TTC	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733611
24	NC_010658	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733611
25	NC_010658	AAT	2	6	1272	1277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187733611
26	NC_010658	GGC	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733611
27	NC_010658	GC	3	6	1332	1337	0 %	0 %	50 %	50 %	187733611
28	NC_010658	TGC	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733611
29	NC_010658	GTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733611
30	NC_010658	ATC	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733611
31	NC_010658	TG	3	6	1434	1439	0 %	50 %	50 %	0 %	187733611
32	NC_010658	AAG	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733611
33	NC_010658	GGT	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733611
34	NC_010658	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733611
35	NC_010658	GAT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733611
36	NC_010658	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733611
37	NC_010658	GCT	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733611
38	NC_010658	CAA	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733611
39	NC_010658	GCTG	2	8	1801	1808	0 %	25 %	50 %	25 %	187733611
40	NC_010658	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733611
41	NC_010658	ATC	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733611
42	NC_010658	TTG	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733611
43	NC_010658	CCAG	2	8	2002	2009	25 %	0 %	25 %	50 %	187733611
44	NC_010658	CTT	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733611
45	NC_010658	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733611
46	NC_010658	TAC	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733611
47	NC_010658	GCG	2	6	2118	2123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733611
48	NC_010658	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733611
49	NC_010658	TGA	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733611
50	NC_010658	ACT	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733611
51	NC_010658	GAT	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733611
52	NC_010658	ATTGAA	2	12	2430	2441	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	187733611
53	NC_010658	TGC	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733611
54	NC_010658	CGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733611
55	NC_010658	CG	4	8	2525	2532	0 %	0 %	50 %	50 %	187733611
56	NC_010658	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733611
57	NC_010658	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733611
58	NC_010658	TGCC	2	8	2594	2601	0 %	25 %	25 %	50 %	187733611
59	NC_010658	TAT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733611
60	NC_010658	TGC	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733611
61	NC_010658	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733021
62	NC_010658	GGC	2	6	2916	2921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733021
63	NC_010658	CAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733021
64	NC_010658	GCAA	2	8	3029	3036	50 %	0 %	25 %	25 %	187733021
65	NC_010658	GGT	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733021
66	NC_010658	ATGA	2	8	3127	3134	50 %	25 %	25 %	0 %	187733021
67	NC_010658	GCA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733021
68	NC_010658	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733021
69	NC_010658	TGA	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733021
70	NC_010658	GAA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733021
71	NC_010658	CAGC	2	8	3282	3289	25 %	0 %	25 %	50 %	187733021
72	NC_010658	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733021
73	NC_010658	CGC	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733021
74	NC_010658	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	187733021
75	NC_010658	CTGG	2	8	3418	3425	0 %	25 %	50 %	25 %	187733021
76	NC_010658	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	187733021
77	NC_010658	TGA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733021
78	NC_010658	AGCG	2	8	3564	3571	25 %	0 %	50 %	25 %	187733021
79	NC_010658	TCCGGC	2	12	3577	3588	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	187733021
80	NC_010658	TG	3	6	3605	3610	0 %	50 %	50 %	0 %	187733021
81	NC_010658	CGG	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733021
82	NC_010658	T	6	6	3820	3825	0 %	100 %	0 %	0 %	187732437
83	NC_010658	CTGA	2	8	3850	3857	25 %	25 %	25 %	25 %	187732437
84	NC_010658	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732437
85	NC_010658	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732437
86	NC_010658	GC	3	6	3960	3965	0 %	0 %	50 %	50 %	187732437
87	NC_010658	CGG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732437
88	NC_010658	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732437
89	NC_010658	TGA	3	9	4323	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732437
90	NC_010658	CTA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732437
91	NC_010658	GC	3	6	4441	4446	0 %	0 %	50 %	50 %	187732437
92	NC_010658	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732437
93	NC_010658	CTG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732437
94	NC_010658	TGC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732437
95	NC_010658	ACG	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732437
96	NC_010658	AAC	2	6	4651	4656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732437
97	NC_010658	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732437
98	NC_010658	CCG	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732437
99	NC_010658	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732437
100	NC_010658	AG	3	6	4881	4886	50 %	0 %	50 %	0 %	187732437
101	NC_010658	CCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732437
102	NC_010658	TGC	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732437
103	NC_010658	TGA	3	9	5000	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732437
104	NC_010658	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732437
105	NC_010658	GCT	2	6	5687	5692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731324
106	NC_010658	GGA	2	6	5724	5729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187731324
107	NC_010658	TCA	2	6	5734	5739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731324
108	NC_010658	AAG	2	6	5740	5745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731324
109	NC_010658	CAGT	2	8	5765	5772	25 %	25 %	25 %	25 %	187731324
110	NC_010658	AAT	2	6	5799	5804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187731324
111	NC_010658	TCA	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731324
112	NC_010658	TGA	2	6	5846	5851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731324
113	NC_010658	TTC	2	6	5866	5871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731324
114	NC_010658	TTC	2	6	5911	5916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731324
115	NC_010658	CAC	2	6	5958	5963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731324
116	NC_010658	TGC	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731324
117	NC_010658	TTG	2	6	5998	6003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731324
118	NC_010658	TGA	2	6	6005	6010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731324
119	NC_010658	AAATCG	2	12	6151	6162	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187731324
120	NC_010658	AGCG	2	8	6269	6276	25 %	0 %	50 %	25 %	187731324
121	NC_010658	CTG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731324
122	NC_010658	GTG	2	6	6400	6405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731324
123	NC_010658	CAT	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730478
124	NC_010658	GCC	2	6	6759	6764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730478
125	NC_010658	AGA	2	6	6830	6835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730478
126	NC_010658	ATC	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730478
127	NC_010658	CGC	2	6	7101	7106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730478
128	NC_010658	TGCCGC	2	12	7107	7118	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	187730478
129	NC_010658	CGC	2	6	7203	7208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730478
130	NC_010658	GCC	2	6	7209	7214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730478
131	NC_010658	GCCA	2	8	7226	7233	25 %	0 %	25 %	50 %	187730478
132	NC_010658	TTA	2	6	7283	7288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187730478
133	NC_010658	CAG	2	6	7386	7391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730478
134	NC_010658	AAT	2	6	7407	7412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730478
135	NC_010658	CG	3	6	7553	7558	0 %	0 %	50 %	50 %	187730478
136	NC_010658	CGG	2	6	7700	7705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730478
137	NC_010658	CG	3	6	7745	7750	0 %	0 %	50 %	50 %	187730478
138	NC_010658	CAA	2	6	7879	7884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730478
139	NC_010658	TAA	2	6	7934	7939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730478
140	NC_010658	A	6	6	7945	7950	100 %	0 %	0 %	0 %	187730478
141	NC_010658	GCAT	2	8	7955	7962	25 %	25 %	25 %	25 %	187730478
142	NC_010658	ACC	2	6	8270	8275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730143
143	NC_010658	CAAC	2	8	8334	8341	50 %	0 %	0 %	50 %	187730143
144	NC_010658	TC	3	6	8345	8350	0 %	50 %	0 %	50 %	187730143
145	NC_010658	CGCAG	2	10	8359	8368	20 %	0 %	40 %	40 %	187730143
146	NC_010658	TTGA	2	8	8387	8394	25 %	50 %	25 %	0 %	187730143
147	NC_010658	CAG	2	6	8417	8422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730143
148	NC_010658	CG	3	6	8432	8437	0 %	0 %	50 %	50 %	187730143
149	NC_010658	CAG	2	6	8438	8443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730143
150	NC_010658	CGAC	2	8	8454	8461	25 %	0 %	25 %	50 %	187730143
151	NC_010658	TGC	2	6	8659	8664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730143
152	NC_010658	AAG	2	6	8679	8684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730143
153	NC_010658	CTG	2	6	8705	8710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730143
154	NC_010658	TTG	2	6	8769	8774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730143
155	NC_010658	AAGA	2	8	8810	8817	75 %	0 %	25 %	0 %	187730143
156	NC_010658	AGA	2	6	8830	8835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730143
157	NC_010658	TAC	2	6	8870	8875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730143
158	NC_010658	CTG	2	6	8978	8983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730143
159	NC_010658	GCTG	2	8	8989	8996	0 %	25 %	50 %	25 %	187730143
160	NC_010658	GCA	2	6	9085	9090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730143
161	NC_010658	A	6	6	9165	9170	100 %	0 %	0 %	0 %	187730143
162	NC_010658	CTG	2	6	9182	9187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730143
163	NC_010658	TGA	2	6	9303	9308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733564
164	NC_010658	GCG	2	6	9354	9359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733564
165	NC_010658	GAA	2	6	9389	9394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733564
166	NC_010658	ATC	2	6	9461	9466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733564
167	NC_010658	TG	3	6	9477	9482	0 %	50 %	50 %	0 %	187733564
168	NC_010658	CAC	2	6	9517	9522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733564
169	NC_010658	CGT	2	6	9542	9547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733564
170	NC_010658	CGTAC	2	10	9787	9796	20 %	20 %	20 %	40 %	187733564
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172	NC_010658	A	7	7	9891	9897	100 %	0 %	0 %	0 %	187733564
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174	NC_010658	CAC	2	6	10010	10015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732969
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177	NC_010658	CAG	2	6	10080	10085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732969
178	NC_010658	GAA	2	6	10149	10154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732969
179	NC_010658	CAG	2	6	10242	10247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732969
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181	NC_010658	T	6	6	10314	10319	0 %	100 %	0 %	0 %	187732969
182	NC_010658	CAG	2	6	10326	10331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732969
183	NC_010658	AAT	2	6	10380	10385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732969
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188	NC_010658	AAT	2	6	10874	10879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732486
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193	NC_010658	CCA	2	6	11132	11137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732486
194	NC_010658	GCG	2	6	11173	11178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732486
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200	NC_010658	CTT	2	6	11512	11517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731912
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211	NC_010658	CAG	2	6	11993	11998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732886
212	NC_010658	TC	4	8	12022	12029	0 %	50 %	0 %	50 %	187732886
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215	NC_010658	CAG	2	6	12126	12131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732886
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220	NC_010658	GCG	2	6	12322	12327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732886
221	NC_010658	CCAT	2	8	12329	12336	25 %	25 %	0 %	50 %	187732886
222	NC_010658	TGT	2	6	13016	13021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732290
223	NC_010658	TCAGAT	2	12	13023	13034	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187732290
224	NC_010658	GCCA	2	8	13110	13117	25 %	0 %	25 %	50 %	187732290
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229	NC_010658	ATCAC	2	10	13307	13316	40 %	20 %	0 %	40 %	187732290
230	NC_010658	T	6	6	13357	13362	0 %	100 %	0 %	0 %	187732290
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232	NC_010658	AGGA	2	8	13583	13590	50 %	0 %	50 %	0 %	187730035
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237	NC_010658	GAG	2	6	13812	13817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187733929
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239	NC_010658	AAT	2	6	14283	14288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187731544
240	NC_010658	TAC	2	6	14304	14309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731544
241	NC_010658	ATGG	2	8	14329	14336	25 %	25 %	50 %	0 %	187731544
242	NC_010658	CAC	2	6	14337	14342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731544
243	NC_010658	CAC	2	6	14376	14381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731544
244	NC_010658	TAT	2	6	14388	14393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187731544
245	NC_010658	TGGT	2	8	14420	14427	0 %	50 %	50 %	0 %	187731544
246	NC_010658	GCC	2	6	14495	14500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731544
247	NC_010658	GAA	2	6	14512	14517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731544
248	NC_010658	CAT	2	6	14535	14540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731544
249	NC_010658	ATT	2	6	14551	14556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187731544
250	NC_010658	GCT	2	6	14557	14562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731544
251	NC_010658	CCG	2	6	14608	14613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731544
252	NC_010658	CTG	2	6	14621	14626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731544
253	NC_010658	A	7	7	14635	14641	100 %	0 %	0 %	0 %	187731544
254	NC_010658	GAA	2	6	14643	14648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731544
255	NC_010658	ATC	2	6	14776	14781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731544
256	NC_010658	ACCG	2	8	14787	14794	25 %	0 %	25 %	50 %	187731544
257	NC_010658	GTG	2	6	14861	14866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731544
258	NC_010658	TAT	2	6	14883	14888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187731544
259	NC_010658	CGA	2	6	14895	14900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731544
260	NC_010658	A	6	6	14912	14917	100 %	0 %	0 %	0 %	187731544
261	NC_010658	GTG	2	6	14957	14962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731544
262	NC_010658	GAA	2	6	14998	15003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731544
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499	NC_010658	GC	3	6	29106	29111	0 %	0 %	50 %	50 %	187733568
500	NC_010658	T	6	6	29251	29256	0 %	100 %	0 %	0 %	187733568

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